De AGUtrecht is een samenwerkingsverband van het Universitair Medisch Centrum Utrecht, Hogeschool Utrecht en de Universiteit Utrecht. De dagelijkse leiding van de AGUtrecht berust bij de directeur van de AGUtrecht Prof. Dr. M.S.H. Duijnstee.

De afdelingen binnen de AGUtrecht worden Kamers genoemd. Momenteel heeft de Academie Gezondheidszorg Utrecht een viertal kamers: Fysiotherapie, Logopedie, Physician Assistant en Verpleegkunde.

Elke Kamer wordt aangestuurd door twee Kamerhoofden. Eén is afkomstig uit het UMC Utrecht, de ander is afkomstig uit de HU.

In de kamers zijn de opleidingen op masterniveau ondergebracht. Aan deze opleidingen zijn zowel onderzoekslijnen als zorgvernieuwingsprojecten gerelateerd. De gedeelde visie van de AGUtrecht garandeert de synergie tussen de kamers.